Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sh3bp1P55194 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sh3bp1P55194 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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