Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PctpP53808 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PctpP53808 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PctpP53808 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PctpP53808 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PctpP53808 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PctpP53808 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PctpP53808 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PctpP53808 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PctpP53808 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PctpP53808 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PctpP53808 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PctpP53808 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PctpP53808 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PctpP53808 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PctpP53808 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PctpP53808 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PctpP53808 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PctpP53808 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PctpP53808 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PctpP53808 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PctpP53808 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PctpP53808 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PctpP53808 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PctpP53808 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PctpP53808 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PctpP53808 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PctpP53808 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PctpP53808 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PctpP53808 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PctpP53808 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PctpP53808 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PctpP53808 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PctpP53808 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PctpP53808 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PctpP53808 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PctpP53808 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PctpP53808 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PctpP53808 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PctpP53808 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PctpP53808 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PctpP53808 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PctpP53808 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PctpP53808 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PctpP53808 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PctpP53808 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PctpP53808 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PctpP53808 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PctpP53808 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PctpP53808 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PctpP53808 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PctpP53808 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PctpP53808 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PctpP53808 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PctpP53808 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PctpP53808 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PctpP53808 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PctpP53808 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PctpP53808 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PctpP53808 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PctpP53808 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PctpP53808 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PctpP53808 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PctpP53808 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PctpP53808 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PctpP53808 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PctpP53808 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PctpP53808 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PctpP53808 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PctpP53808 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PctpP53808 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PctpP53808 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PctpP53808 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PctpP53808 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PctpP53808 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PctpP53808 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PctpP53808 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PctpP53808 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PctpP53808 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PctpP53808 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PctpP53808 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PctpP53808 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PctpP53808 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PctpP53808 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PctpP53808 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PctpP53808 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PctpP53808 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PctpP53808 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PctpP53808 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PctpP53808 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PctpP53808 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PctpP53808 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PctpP53808 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PctpP53808 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PctpP53808 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PctpP53808 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PctpP53808 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PctpP53808 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PctpP53808 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PctpP53808 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms