Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2e3P52483 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms