Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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PtpreP49446 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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PtpreP49446 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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PtpreP49446 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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PtpreP49446 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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PtpreP49446 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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PtpreP49446 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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PtpreP49446 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtpreP49446 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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PtpreP49446 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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PtpreP49446 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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PtpreP49446 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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PtpreP49446 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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PtpreP49446 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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PtpreP49446 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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