Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc10P31257 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc10P31257 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc10P31257 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc10P31257 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc10P31257 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc10P31257 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc10P31257 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc10P31257 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc10P31257 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc10P31257 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc10P31257 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc10P31257 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc10P31257 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc10P31257 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc10P31257 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc10P31257 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc10P31257 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc10P31257 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc10P31257 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc10P31257 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc10P31257 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc10P31257 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc10P31257 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc10P31257 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc10P31257 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc10P31257 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc10P31257 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc10P31257 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc10P31257 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc10P31257 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc10P31257 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc10P31257 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc10P31257 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc10P31257 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc10P31257 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc10P31257 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc10P31257 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc10P31257 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc10P31257 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc10P31257 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc10P31257 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc10P31257 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Hoxc10P31257 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc10P31257 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc10P31257 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc10P31257 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc10P31257 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc10P31257 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc10P31257 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc10P31257 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc10P31257 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc10P31257 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc10P31257 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc10P31257 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc10P31257 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxc10P31257 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxc10P31257 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxc10P31257 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxc10P31257 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxc10P31257 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxc10P31257 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxc10P31257 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxc10P31257 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxc10P31257 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc10P31257 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc10P31257 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc10P31257 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc10P31257 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc10P31257 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc10P31257 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc10P31257 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc10P31257 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc10P31257 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc10P31257 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc10P31257 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc10P31257 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc10P31257 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc10P31257 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc10P31257 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc10P31257 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc10P31257 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc10P31257 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc10P31257 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc10P31257 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc10P31257 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc10P31257 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc10P31257 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc10P31257 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc10P31257 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc10P31257 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc10P31257 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc10P31257 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc10P31257 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc10P31257 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc10P31257 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc10P31257 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxc10P31257 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.7 ms