Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms