Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PparaP23204 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PparaP23204 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PparaP23204 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PparaP23204 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PparaP23204 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PparaP23204 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PparaP23204 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PparaP23204 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PparaP23204 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PparaP23204 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PparaP23204 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PparaP23204 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PparaP23204 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
PparaP23204 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.2
PparaP23204 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.2
PparaP23204 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PparaP23204 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PparaP23204 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PparaP23204 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PparaP23204 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PparaP23204 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PparaP23204 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PparaP23204 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PparaP23204 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PparaP23204 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PparaP23204 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PparaP23204 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PparaP23204 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PparaP23204 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PparaP23204 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PparaP23204 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PparaP23204 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PparaP23204 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PparaP23204 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PparaP23204 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PparaP23204 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PparaP23204 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PparaP23204 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PparaP23204 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PparaP23204 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PparaP23204 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PparaP23204 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PparaP23204 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PparaP23204 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PparaP23204 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PparaP23204 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PparaP23204 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PparaP23204 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PparaP23204 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PparaP23204 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PparaP23204 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PparaP23204 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PparaP23204 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PparaP23204 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PparaP23204 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PparaP23204 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PparaP23204 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PparaP23204 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PparaP23204 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PparaP23204 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PparaP23204 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PparaP23204 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PparaP23204 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PparaP23204 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PparaP23204 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PparaP23204 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PparaP23204 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PparaP23204 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PparaP23204 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PparaP23204 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PparaP23204 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PparaP23204 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PparaP23204 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PparaP23204 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PparaP23204 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PparaP23204 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PparaP23204 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PparaP23204 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PparaP23204 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PparaP23204 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PparaP23204 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PparaP23204 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PparaP23204 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PparaP23204 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PparaP23204 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PparaP23204 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PparaP23204 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PparaP23204 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PparaP23204 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PparaP23204 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PparaP23204 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PparaP23204 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PparaP23204 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PparaP23204 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PparaP23204 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PparaP23204 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PparaP23204 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PparaP23204 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PparaP23204 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms