Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnnc2P20801 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnnc2P20801 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnnc2P20801 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnnc2P20801 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnnc2P20801 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnnc2P20801 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnnc2P20801 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnnc2P20801 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnnc2P20801 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnnc2P20801 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc2P20801 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc2P20801 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc2P20801 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc2P20801 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc2P20801 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc2P20801 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc2P20801 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc2P20801 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc2P20801 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc2P20801 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc2P20801 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc2P20801 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc2P20801 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc2P20801 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc2P20801 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc2P20801 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc2P20801 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc2P20801 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc2P20801 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc2P20801 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc2P20801 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc2P20801 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc2P20801 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc2P20801 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc2P20801 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc2P20801 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc2P20801 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc2P20801 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc2P20801 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc2P20801 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc2P20801 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc2P20801 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc2P20801 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc2P20801 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc2P20801 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc2P20801 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc2P20801 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc2P20801 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc2P20801 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc2P20801 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc2P20801 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc2P20801 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tnnc2P20801 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tnnc2P20801 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tnnc2P20801 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tnnc2P20801 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tnnc2P20801 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tnnc2P20801 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms