Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pou5f1P20263 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms