Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr4a1P12813 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms