Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P10404 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
P10404 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P10404 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P10404 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P10404 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P10404 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P10404 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P10404 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P10404 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P10404 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P10404 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P10404 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P10404 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P10404 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P10404 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P10404 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P10404 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P10404 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P10404 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P10404 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P10404 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P10404 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P10404 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P10404 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P10404 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P10404 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P10404 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P10404 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P10404 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P10404 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P10404 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P10404 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P10404 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P10404 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P10404 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P10404 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P10404 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P10404 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P10404 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P10404 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P10404 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P10404 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P10404 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P10404 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P10404 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P10404 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P10404 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P10404 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P10404 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P10404 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P10404 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P10404 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P10404 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P10404 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P10404 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P10404 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P10404 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P10404 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P10404 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P10404 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P10404 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P10404 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P10404 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P10404 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P10404 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P10404 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P10404 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P10404 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P10404 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P10404 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P10404 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P10404 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P10404 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P10404 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P10404 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P10404 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P10404 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P10404 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P10404 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P10404 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P10404 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P10404 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P10404 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P10404 Gm12962-202ENSMUST00000144212 691 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P10404 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P10404 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P10404 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P10404 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P10404 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P10404 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P10404 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P10404 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P10404 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P10404 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P10404 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P10404 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P10404 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P10404 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P10404 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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