Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01649 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01649 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01649 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01649 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01649 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01649 Gm29151-201ENSMUST00000196669 2513 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01649 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01649 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01649 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01649 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01649 Defa-ps4-201ENSMUST00000118021 183 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P01649 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P01649 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01649 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P01649 Gm43452-201ENSMUST00000201873 991 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P01649 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P01649 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P01649 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01649 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01649 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01649 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01649 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01649 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01649 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01649 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01649 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01649 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01649 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01649 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01649 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01649 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01649 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01649 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01649 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01649 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01649 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01649 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01649 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01649 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01649 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P01649 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01649 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01649 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01649 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01649 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01649 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01649 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P01649 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01649 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01649 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01649 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01649 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01649 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01649 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01649 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P01649 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01649 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01649 Gm15074-201ENSMUST00000117603 936 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P01649 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01649 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01649 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01649 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01649 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01649 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01649 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01649 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P01649 Gm8502-201ENSMUST00000185708 901 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P01649 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P01649 Gm8510-201ENSMUST00000189202 895 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P01649 Gm2316-201ENSMUST00000190613 921 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P01649 Gm37293-201ENSMUST00000191658 295 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P01649 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01649 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01649 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P01649 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P01649 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01649 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01649 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01649 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01649 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01649 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01649 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01649 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01649 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01649 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01649 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01649 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01649 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01649 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01649 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01649 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01649 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01649 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01649 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01649 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01649 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01649 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01649 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01649 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms