Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Ccl20O89093 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Ccl20O89093 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Ccl20O89093 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Ccl20O89093 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl20O89093 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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