Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CrxO54751 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CrxO54751 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CrxO54751 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CrxO54751 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CrxO54751 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CrxO54751 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CrxO54751 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CrxO54751 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CrxO54751 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CrxO54751 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CrxO54751 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CrxO54751 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CrxO54751 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CrxO54751 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CrxO54751 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CrxO54751 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CrxO54751 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CrxO54751 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CrxO54751 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CrxO54751 Adcy7-201ENSMUST00000098521 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CrxO54751 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CrxO54751 Svil-204ENSMUST00000127297 6243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CrxO54751 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
CrxO54751 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CrxO54751 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
CrxO54751 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
CrxO54751 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CrxO54751 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
CrxO54751 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CrxO54751 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
CrxO54751 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
CrxO54751 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
CrxO54751 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CrxO54751 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CrxO54751 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CrxO54751 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CrxO54751 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CrxO54751 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CrxO54751 Fer1l5-202ENSMUST00000179162 6315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CrxO54751 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CrxO54751 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CrxO54751 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CrxO54751 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CrxO54751 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CrxO54751 Myo7a-202ENSMUST00000107122 6867 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CrxO54751 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CrxO54751 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CrxO54751 Il1r1-201ENSMUST00000027241 5819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CrxO54751 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CrxO54751 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CrxO54751 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CrxO54751 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
CrxO54751 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
CrxO54751 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
CrxO54751 Fam227a-203ENSMUST00000109648 5187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
CrxO54751 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CrxO54751 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CrxO54751 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CrxO54751 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CrxO54751 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CrxO54751 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CrxO54751 Olfr1219-204ENSMUST00000215225 5865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
CrxO54751 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
CrxO54751 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CrxO54751 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CrxO54751 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
CrxO54751 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CrxO54751 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CrxO54751 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CrxO54751 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
CrxO54751 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CrxO54751 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
CrxO54751 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
CrxO54751 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CrxO54751 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CrxO54751 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CrxO54751 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CrxO54751 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CrxO54751 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CrxO54751 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CrxO54751 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CrxO54751 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CrxO54751 Zfp398-202ENSMUST00000114598 8328 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CrxO54751 Cacna1f-201ENSMUST00000115725 6028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
CrxO54751 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CrxO54751 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
CrxO54751 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CrxO54751 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CrxO54751 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CrxO54751 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CrxO54751 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
CrxO54751 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
CrxO54751 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
CrxO54751 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CrxO54751 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
CrxO54751 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CrxO54751 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
CrxO54751 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CrxO54751 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms