Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Dgcr6O35347 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms