Protein–RNA interactions for Protein: O35309

Nmi, N-myc-interactor, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmiO35309 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NmiO35309 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NmiO35309 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NmiO35309 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NmiO35309 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NmiO35309 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NmiO35309 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NmiO35309 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NmiO35309 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NmiO35309 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NmiO35309 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NmiO35309 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NmiO35309 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NmiO35309 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NmiO35309 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NmiO35309 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NmiO35309 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NmiO35309 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NmiO35309 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NmiO35309 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NmiO35309 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NmiO35309 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NmiO35309 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NmiO35309 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NmiO35309 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NmiO35309 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NmiO35309 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NmiO35309 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NmiO35309 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NmiO35309 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NmiO35309 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NmiO35309 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
NmiO35309 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NmiO35309 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NmiO35309 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NmiO35309 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NmiO35309 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NmiO35309 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NmiO35309 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
NmiO35309 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NmiO35309 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NmiO35309 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NmiO35309 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NmiO35309 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NmiO35309 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NmiO35309 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NmiO35309 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NmiO35309 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NmiO35309 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NmiO35309 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NmiO35309 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NmiO35309 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
NmiO35309 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NmiO35309 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NmiO35309 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NmiO35309 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NmiO35309 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NmiO35309 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NmiO35309 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NmiO35309 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NmiO35309 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NmiO35309 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NmiO35309 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NmiO35309 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NmiO35309 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NmiO35309 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NmiO35309 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NmiO35309 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NmiO35309 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NmiO35309 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NmiO35309 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NmiO35309 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NmiO35309 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NmiO35309 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NmiO35309 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NmiO35309 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NmiO35309 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NmiO35309 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NmiO35309 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NmiO35309 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NmiO35309 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NmiO35309 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NmiO35309 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NmiO35309 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NmiO35309 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NmiO35309 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NmiO35309 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NmiO35309 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
NmiO35309 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NmiO35309 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NmiO35309 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NmiO35309 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NmiO35309 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NmiO35309 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NmiO35309 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NmiO35309 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NmiO35309 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NmiO35309 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NmiO35309 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC15.05■□□□□ 0
NmiO35309 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms