Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

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Length 103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20878L7N244 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20878L7N244 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20878L7N244 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20878L7N244 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20878L7N244 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20878L7N244 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20878L7N244 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20878L7N244 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20878L7N244 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20878L7N244 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20878L7N244 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20878L7N244 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20878L7N244 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20878L7N244 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20878L7N244 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20878L7N244 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20878L7N244 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20878L7N244 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20878L7N244 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20878L7N244 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20878L7N244 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20878L7N244 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20878L7N244 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20878L7N244 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20878L7N244 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20878L7N244 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20878L7N244 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20878L7N244 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20878L7N244 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20878L7N244 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20878L7N244 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20878L7N244 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20878L7N244 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20878L7N244 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20878L7N244 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20878L7N244 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20878L7N244 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20878L7N244 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20878L7N244 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20878L7N244 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20878L7N244 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20878L7N244 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20878L7N244 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20878L7N244 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20878L7N244 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20878L7N244 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20878L7N244 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20878L7N244 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20878L7N244 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20878L7N244 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20878L7N244 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20878L7N244 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20878L7N244 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20878L7N244 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20878L7N244 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20878L7N244 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20878L7N244 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20878L7N244 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20878L7N244 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20878L7N244 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20878L7N244 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20878L7N244 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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