Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3542K7N6U2 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3542K7N6U2 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm3542K7N6U2 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3542K7N6U2 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3542K7N6U2 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3542K7N6U2 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3542K7N6U2 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3542K7N6U2 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3542K7N6U2 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3542K7N6U2 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3542K7N6U2 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3542K7N6U2 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3542K7N6U2 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3542K7N6U2 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3542K7N6U2 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3542K7N6U2 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3542K7N6U2 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3542K7N6U2 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3542K7N6U2 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3542K7N6U2 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3542K7N6U2 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3542K7N6U2 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3542K7N6U2 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3542K7N6U2 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3542K7N6U2 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3542K7N6U2 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3542K7N6U2 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3542K7N6U2 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3542K7N6U2 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3542K7N6U2 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3542K7N6U2 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3542K7N6U2 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3542K7N6U2 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3542K7N6U2 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3542K7N6U2 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3542K7N6U2 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3542K7N6U2 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3542K7N6U2 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3542K7N6U2 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3542K7N6U2 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3542K7N6U2 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3542K7N6U2 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3542K7N6U2 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3542K7N6U2 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3542K7N6U2 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3542K7N6U2 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3542K7N6U2 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3542K7N6U2 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3542K7N6U2 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3542K7N6U2 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3542K7N6U2 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm3542K7N6U2 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Gm3542K7N6U2 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Gm3542K7N6U2 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Gm3542K7N6U2 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Gm3542K7N6U2 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Gm3542K7N6U2 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3542K7N6U2 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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