Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

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Length 637 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem200cJ3QK46 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem200cJ3QK46 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem200cJ3QK46 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem200cJ3QK46 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem200cJ3QK46 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem200cJ3QK46 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem200cJ3QK46 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem200cJ3QK46 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem200cJ3QK46 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem200cJ3QK46 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem200cJ3QK46 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem200cJ3QK46 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem200cJ3QK46 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem200cJ3QK46 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem200cJ3QK46 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem200cJ3QK46 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem200cJ3QK46 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem200cJ3QK46 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem200cJ3QK46 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem200cJ3QK46 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem200cJ3QK46 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem200cJ3QK46 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem200cJ3QK46 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem200cJ3QK46 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem200cJ3QK46 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem200cJ3QK46 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem200cJ3QK46 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem200cJ3QK46 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem200cJ3QK46 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem200cJ3QK46 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem200cJ3QK46 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem200cJ3QK46 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem200cJ3QK46 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem200cJ3QK46 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem200cJ3QK46 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem200cJ3QK46 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem200cJ3QK46 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem200cJ3QK46 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem200cJ3QK46 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem200cJ3QK46 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem200cJ3QK46 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem200cJ3QK46 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Tmem200cJ3QK46 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
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Tmem200cJ3QK46 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem200cJ3QK46 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Tmem200cJ3QK46 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem200cJ3QK46 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem200cJ3QK46 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem200cJ3QK46 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem200cJ3QK46 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem200cJ3QK46 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Tmem200cJ3QK46 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem200cJ3QK46 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Tmem200cJ3QK46 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem200cJ3QK46 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Tmem200cJ3QK46 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem200cJ3QK46 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem200cJ3QK46 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem200cJ3QK46 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem200cJ3QK46 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem200cJ3QK46 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem200cJ3QK46 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem200cJ3QK46 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem200cJ3QK46 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem200cJ3QK46 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem200cJ3QK46 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem200cJ3QK46 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem200cJ3QK46 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem200cJ3QK46 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem200cJ3QK46 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem200cJ3QK46 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem200cJ3QK46 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem200cJ3QK46 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem200cJ3QK46 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem200cJ3QK46 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem200cJ3QK46 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem200cJ3QK46 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem200cJ3QK46 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem200cJ3QK46 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem200cJ3QK46 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem200cJ3QK46 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem200cJ3QK46 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem200cJ3QK46 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem200cJ3QK46 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem200cJ3QK46 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem200cJ3QK46 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 658.5 ms