Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm20828J3KMI7 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms