Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

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Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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