Protein–RNA interactions for Protein: G5E861

Sclt1, Sodium channel and clathrin linker 1, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sclt1G5E861 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sclt1G5E861 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms