Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf148G3X9R7 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.4 ms