Protein–RNA interactions for Protein: G3X9N5

Nxph4, Neurexophilin, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxph4G3X9N5 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nxph4G3X9N5 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nxph4G3X9N5 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nxph4G3X9N5 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nxph4G3X9N5 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nxph4G3X9N5 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Nxph4G3X9N5 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Nxph4G3X9N5 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Nxph4G3X9N5 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Nxph4G3X9N5 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Nxph4G3X9N5 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Nxph4G3X9N5 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nxph4G3X9N5 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Nxph4G3X9N5 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nxph4G3X9N5 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nxph4G3X9N5 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Nxph4G3X9N5 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Nxph4G3X9N5 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nxph4G3X9N5 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nxph4G3X9N5 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nxph4G3X9N5 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nxph4G3X9N5 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nxph4G3X9N5 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nxph4G3X9N5 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nxph4G3X9N5 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nxph4G3X9N5 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nxph4G3X9N5 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nxph4G3X9N5 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Nxph4G3X9N5 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nxph4G3X9N5 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nxph4G3X9N5 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nxph4G3X9N5 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nxph4G3X9N5 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nxph4G3X9N5 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nxph4G3X9N5 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nxph4G3X9N5 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nxph4G3X9N5 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nxph4G3X9N5 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Nxph4G3X9N5 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Nxph4G3X9N5 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Nxph4G3X9N5 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Nxph4G3X9N5 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Nxph4G3X9N5 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Nxph4G3X9N5 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Nxph4G3X9N5 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Nxph4G3X9N5 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nxph4G3X9N5 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nxph4G3X9N5 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nxph4G3X9N5 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nxph4G3X9N5 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nxph4G3X9N5 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nxph4G3X9N5 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nxph4G3X9N5 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nxph4G3X9N5 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nxph4G3X9N5 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nxph4G3X9N5 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nxph4G3X9N5 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Nxph4G3X9N5 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nxph4G3X9N5 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nxph4G3X9N5 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nxph4G3X9N5 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nxph4G3X9N5 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nxph4G3X9N5 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nxph4G3X9N5 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Nxph4G3X9N5 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nxph4G3X9N5 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nxph4G3X9N5 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Nxph4G3X9N5 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nxph4G3X9N5 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Nxph4G3X9N5 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Nxph4G3X9N5 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nxph4G3X9N5 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nxph4G3X9N5 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nxph4G3X9N5 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nxph4G3X9N5 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nxph4G3X9N5 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nxph4G3X9N5 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nxph4G3X9N5 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nxph4G3X9N5 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nxph4G3X9N5 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nxph4G3X9N5 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nxph4G3X9N5 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nxph4G3X9N5 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nxph4G3X9N5 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nxph4G3X9N5 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nxph4G3X9N5 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nxph4G3X9N5 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nxph4G3X9N5 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nxph4G3X9N5 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Nxph4G3X9N5 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nxph4G3X9N5 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nxph4G3X9N5 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nxph4G3X9N5 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Nxph4G3X9N5 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nxph4G3X9N5 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nxph4G3X9N5 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nxph4G3X9N5 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nxph4G3X9N5 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nxph4G3X9N5 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Nxph4G3X9N5 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms