Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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