Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Moxd2-201ENSMUST00000031937 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Tprkb-204ENSMUST00000113752 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Gsdmcl2-202ENSMUST00000185391 796 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Gm38103-201ENSMUST00000191707 864 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Gm43726-201ENSMUST00000199110 775 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Tmod3-205ENSMUST00000215821 898 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
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Usp9yF8VPU6 Gm15658-201ENSMUST00000148293 574 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 1700085C21Rik-201ENSMUST00000187123 1082 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Gm44777-203ENSMUST00000206930 571 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
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Usp9yF8VPU6 Rps18-201ENSMUST00000008812 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
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Usp9yF8VPU6 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
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Usp9yF8VPU6 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
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Usp9yF8VPU6 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Tbc1d21-201ENSMUST00000040217 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Gm42432-201ENSMUST00000197902 1617 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms