Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 AC124752.1-201ENSMUST00000222131 776 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Gm5513-201ENSMUST00000072982 1218 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 2310034O05Rik-201ENSMUST00000185221 1107 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Fam114a2-202ENSMUST00000108850 1765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syngap1F6SEU4 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms