Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Gm340F6RGI3 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm340F6RGI3 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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