Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.4 ms