Protein–RNA interactions for Protein: B1AY10

Nfx1, Transcriptional repressor NF-X1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfx1B1AY10 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
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Nfx1B1AY10 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nfx1B1AY10 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms