Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F0

Ttll7, Tubulin polyglutamylase TTLL7, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll7A4Q9F0 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ttll7A4Q9F0 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.2 ms