Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Ehmt1-205ENSMUST00000114432 4539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Pum1-201ENSMUST00000030315 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Spen-202ENSMUST00000105786 12299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Gria1-201ENSMUST00000036315 5546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Ar-201ENSMUST00000052837 10048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Cacna1f-201ENSMUST00000115725 6028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Epb41-202ENSMUST00000054917 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Galnt16-206ENSMUST00000219993 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vamp5Q9Z2P8 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms