Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Ilf3Q9Z1X4 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ilf3Q9Z1X4 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms