Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z121

Ccl8, C-C motif chemokine 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl8Q9Z121 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Ccl8Q9Z121 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Ccl8Q9Z121 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Ccl8Q9Z121 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Ccl8Q9Z121 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Ccl8Q9Z121 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
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Ccl8Q9Z121 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Ccl8Q9Z121 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Ccl8Q9Z121 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Ccl8Q9Z121 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Ccl8Q9Z121 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Ccl8Q9Z121 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Ccl8Q9Z121 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Ccl8Q9Z121 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Ccl8Q9Z121 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Ccl8Q9Z121 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Ccl8Q9Z121 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Ccl8Q9Z121 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl8Q9Z121 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Ccl8Q9Z121 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms