Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Plod3Q9R0E1 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms