Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms