Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Csnk1eQ9JMK2 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Csnk1eQ9JMK2 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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