Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME5

Ap3b2, AP-3 complex subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b2Q9JME5 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ap3b2Q9JME5 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ap3b2Q9JME5 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ap3b2Q9JME5 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ap3b2Q9JME5 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ap3b2Q9JME5 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ap3b2Q9JME5 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ap3b2Q9JME5 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ap3b2Q9JME5 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ap3b2Q9JME5 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ap3b2Q9JME5 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ap3b2Q9JME5 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ap3b2Q9JME5 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ap3b2Q9JME5 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ap3b2Q9JME5 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ap3b2Q9JME5 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ap3b2Q9JME5 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ap3b2Q9JME5 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ap3b2Q9JME5 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ap3b2Q9JME5 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ap3b2Q9JME5 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ap3b2Q9JME5 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ap3b2Q9JME5 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ap3b2Q9JME5 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ap3b2Q9JME5 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ap3b2Q9JME5 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ap3b2Q9JME5 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ap3b2Q9JME5 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ap3b2Q9JME5 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ap3b2Q9JME5 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ap3b2Q9JME5 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ap3b2Q9JME5 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ap3b2Q9JME5 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ap3b2Q9JME5 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ap3b2Q9JME5 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ap3b2Q9JME5 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms