Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

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Length 1,070 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ube3bQ9ES34 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ube3bQ9ES34 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ube3bQ9ES34 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube3bQ9ES34 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube3bQ9ES34 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube3bQ9ES34 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube3bQ9ES34 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube3bQ9ES34 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube3bQ9ES34 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube3bQ9ES34 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube3bQ9ES34 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube3bQ9ES34 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube3bQ9ES34 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube3bQ9ES34 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube3bQ9ES34 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube3bQ9ES34 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube3bQ9ES34 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube3bQ9ES34 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube3bQ9ES34 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube3bQ9ES34 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube3bQ9ES34 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube3bQ9ES34 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube3bQ9ES34 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube3bQ9ES34 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube3bQ9ES34 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube3bQ9ES34 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube3bQ9ES34 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube3bQ9ES34 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube3bQ9ES34 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube3bQ9ES34 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube3bQ9ES34 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube3bQ9ES34 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube3bQ9ES34 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube3bQ9ES34 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube3bQ9ES34 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube3bQ9ES34 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube3bQ9ES34 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube3bQ9ES34 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube3bQ9ES34 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube3bQ9ES34 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube3bQ9ES34 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Ube3bQ9ES34 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Ube3bQ9ES34 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube3bQ9ES34 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube3bQ9ES34 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube3bQ9ES34 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube3bQ9ES34 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube3bQ9ES34 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube3bQ9ES34 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube3bQ9ES34 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube3bQ9ES34 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Ube3bQ9ES34 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube3bQ9ES34 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube3bQ9ES34 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Ube3bQ9ES34 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube3bQ9ES34 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Ube3bQ9ES34 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Ube3bQ9ES34 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Ube3bQ9ES34 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube3bQ9ES34 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube3bQ9ES34 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube3bQ9ES34 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube3bQ9ES34 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube3bQ9ES34 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube3bQ9ES34 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube3bQ9ES34 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube3bQ9ES34 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube3bQ9ES34 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube3bQ9ES34 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube3bQ9ES34 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube3bQ9ES34 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube3bQ9ES34 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube3bQ9ES34 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube3bQ9ES34 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms