Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM5

Rhox9, Homeobox protein GPBOX, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox9Q9EQM5 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rhox9Q9EQM5 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rhox9Q9EQM5 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rhox9Q9EQM5 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rhox9Q9EQM5 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rhox9Q9EQM5 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rhox9Q9EQM5 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rhox9Q9EQM5 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rhox9Q9EQM5 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rhox9Q9EQM5 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rhox9Q9EQM5 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rhox9Q9EQM5 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rhox9Q9EQM5 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rhox9Q9EQM5 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Rhox9Q9EQM5 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Rhox9Q9EQM5 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Rhox9Q9EQM5 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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