Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Chmp4bQ9D8B3 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp4bQ9D8B3 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms