Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Syce1Q9D495 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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