Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Snx20Q9D2Y5 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Snx20Q9D2Y5 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Snx20Q9D2Y5 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Snx20Q9D2Y5 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Snx20Q9D2Y5 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Snx20Q9D2Y5 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Snx20Q9D2Y5 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Snx20Q9D2Y5 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Snx20Q9D2Y5 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Snx20Q9D2Y5 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Snx20Q9D2Y5 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Snx20Q9D2Y5 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Snx20Q9D2Y5 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Snx20Q9D2Y5 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Snx20Q9D2Y5 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Snx20Q9D2Y5 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Snx20Q9D2Y5 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms