Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zbed3Q9D0L1 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms