Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW2

Cenpn, Centromere protein N, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpnQ9CZW2 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
CenpnQ9CZW2 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
CenpnQ9CZW2 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CenpnQ9CZW2 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CenpnQ9CZW2 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CenpnQ9CZW2 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
CenpnQ9CZW2 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
CenpnQ9CZW2 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CenpnQ9CZW2 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CenpnQ9CZW2 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CenpnQ9CZW2 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
CenpnQ9CZW2 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CenpnQ9CZW2 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CenpnQ9CZW2 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CenpnQ9CZW2 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CenpnQ9CZW2 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CenpnQ9CZW2 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CenpnQ9CZW2 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CenpnQ9CZW2 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CenpnQ9CZW2 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CenpnQ9CZW2 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CenpnQ9CZW2 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CenpnQ9CZW2 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CenpnQ9CZW2 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
CenpnQ9CZW2 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CenpnQ9CZW2 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CenpnQ9CZW2 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CenpnQ9CZW2 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CenpnQ9CZW2 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CenpnQ9CZW2 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CenpnQ9CZW2 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CenpnQ9CZW2 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CenpnQ9CZW2 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CenpnQ9CZW2 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CenpnQ9CZW2 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CenpnQ9CZW2 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
CenpnQ9CZW2 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CenpnQ9CZW2 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CenpnQ9CZW2 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CenpnQ9CZW2 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
CenpnQ9CZW2 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CenpnQ9CZW2 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CenpnQ9CZW2 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CenpnQ9CZW2 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CenpnQ9CZW2 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
CenpnQ9CZW2 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CenpnQ9CZW2 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CenpnQ9CZW2 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
CenpnQ9CZW2 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CenpnQ9CZW2 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CenpnQ9CZW2 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CenpnQ9CZW2 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CenpnQ9CZW2 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CenpnQ9CZW2 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CenpnQ9CZW2 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CenpnQ9CZW2 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CenpnQ9CZW2 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CenpnQ9CZW2 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CenpnQ9CZW2 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CenpnQ9CZW2 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CenpnQ9CZW2 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CenpnQ9CZW2 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
CenpnQ9CZW2 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
CenpnQ9CZW2 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
CenpnQ9CZW2 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
CenpnQ9CZW2 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
CenpnQ9CZW2 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
CenpnQ9CZW2 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
CenpnQ9CZW2 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
CenpnQ9CZW2 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
CenpnQ9CZW2 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
CenpnQ9CZW2 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
CenpnQ9CZW2 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CenpnQ9CZW2 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CenpnQ9CZW2 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CenpnQ9CZW2 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CenpnQ9CZW2 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CenpnQ9CZW2 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CenpnQ9CZW2 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CenpnQ9CZW2 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CenpnQ9CZW2 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CenpnQ9CZW2 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CenpnQ9CZW2 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CenpnQ9CZW2 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
CenpnQ9CZW2 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CenpnQ9CZW2 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
CenpnQ9CZW2 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CenpnQ9CZW2 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CenpnQ9CZW2 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CenpnQ9CZW2 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
CenpnQ9CZW2 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CenpnQ9CZW2 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CenpnQ9CZW2 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
CenpnQ9CZW2 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CenpnQ9CZW2 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CenpnQ9CZW2 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
CenpnQ9CZW2 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CenpnQ9CZW2 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CenpnQ9CZW2 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CenpnQ9CZW2 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms