Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXZ1

Ndufs4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs4Q9CXZ1 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufs4Q9CXZ1 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufs4Q9CXZ1 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufs4Q9CXZ1 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufs4Q9CXZ1 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufs4Q9CXZ1 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufs4Q9CXZ1 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufs4Q9CXZ1 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufs4Q9CXZ1 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufs4Q9CXZ1 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufs4Q9CXZ1 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufs4Q9CXZ1 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufs4Q9CXZ1 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufs4Q9CXZ1 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufs4Q9CXZ1 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufs4Q9CXZ1 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufs4Q9CXZ1 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufs4Q9CXZ1 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufs4Q9CXZ1 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufs4Q9CXZ1 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufs4Q9CXZ1 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufs4Q9CXZ1 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufs4Q9CXZ1 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufs4Q9CXZ1 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufs4Q9CXZ1 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufs4Q9CXZ1 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufs4Q9CXZ1 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufs4Q9CXZ1 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufs4Q9CXZ1 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufs4Q9CXZ1 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufs4Q9CXZ1 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufs4Q9CXZ1 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufs4Q9CXZ1 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufs4Q9CXZ1 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufs4Q9CXZ1 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufs4Q9CXZ1 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufs4Q9CXZ1 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufs4Q9CXZ1 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufs4Q9CXZ1 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufs4Q9CXZ1 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufs4Q9CXZ1 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufs4Q9CXZ1 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufs4Q9CXZ1 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufs4Q9CXZ1 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufs4Q9CXZ1 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufs4Q9CXZ1 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufs4Q9CXZ1 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufs4Q9CXZ1 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufs4Q9CXZ1 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufs4Q9CXZ1 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufs4Q9CXZ1 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufs4Q9CXZ1 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufs4Q9CXZ1 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufs4Q9CXZ1 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufs4Q9CXZ1 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufs4Q9CXZ1 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms