Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXV1

Sdhd, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b small subunit, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdhdQ9CXV1 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms