Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhobtb3Q9CTN4 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhobtb3Q9CTN4 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhobtb3Q9CTN4 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhobtb3Q9CTN4 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhobtb3Q9CTN4 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhobtb3Q9CTN4 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhobtb3Q9CTN4 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rhobtb3Q9CTN4 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rhobtb3Q9CTN4 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rhobtb3Q9CTN4 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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