Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.1 ms