Protein–RNA interactions for Protein: Q99N89

Mrpl43, 39S ribosomal protein L43, mitochondrial, mousemouse

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl43Q99N89 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
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Mrpl43Q99N89 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Mrpl43Q99N89 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Mrpl43Q99N89 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Mrpl43Q99N89 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Mrpl43Q99N89 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Mrpl43Q99N89 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Mrpl43Q99N89 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Mrpl43Q99N89 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Mrpl43Q99N89 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl43Q99N89 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms